《古剑奇谭》系列自推出以来，每一部作品都以其独特的魅力、精美的画面、丰富的角色设定以及深刻的剧情赢得了众多玩家的喜爱，要评判哪一款游戏在独特魅力与深度剧情上更胜一筹，实际上是一个相当主观的问题，因为不同玩家对于游戏的喜好和侧重点可能有所不同，不过，我们可以从几个维度来探讨这个问题。

1、《古剑奇谭：琴心剑魄今何在》（简称古剑一）：作为系列的开山之作，古剑一在剧情上构建了一个宏大的世界观，讲述了百里屠苏与风晴雪等人在寻找重生之法的过程中，逐渐揭开身世之谜，并面对种种抉择与牺牲的故事，其剧情深刻而感人，角色塑造饱满，尤其是百里屠苏与风晴雪之间的情感纠葛，让许多玩家为之动容，古剑一还融入了丰富的中国传统文化元素，如琴棋书画、诗词歌赋等，增加了游戏的文化底蕴。

2、《古剑奇谭二：永夜初晗凝碧天》（简称古剑二）：古剑二在剧情上同样有着不俗的表现，它构建了一个更为复杂的社会结构和人际关系网，通过乐无异、闻人羽、夏夷则等主角的视角，展现了不同势力之间的冲突与合作，古剑二在剧情上更加注重人物内心的探索与成长，以及对于“道”与“义”的深刻思考，游戏还引入了即时战斗系统，为玩家带来了更加刺激的战斗体验。

3、后续作品：系列的不断发展，后续作品如《古剑奇谭三：梦付千秋星垂野》等也在剧情和玩法上进行了诸多创新，古剑三在剧情上延续了系列一贯的深刻与感人，同时更加注重世界观的构建和角色之间的情感纽带，古剑三还采用了全即时战斗模式，进一步提升了游戏的战斗体验。

要评判哪一款《古剑奇谭》游戏在独特魅力与深度剧情上更胜一筹并不容易，因为每一部作品都有其独特的魅力和亮点，如果要从剧情的深度和感人程度来看，古剑一和古剑三都受到了广泛的好评；而如果从世界观构建的复杂性和角色塑造的多样性来看，古剑二也同样值得称赞，玩家可以根据自己的喜好和侧重点来选择适合自己的作品。